מכון ירושלים הוא מכון מחקר וחשיבה. ייעודו של מכון ירושלים הוא להשפיע על עיצוב מדיניות, תהליכי קבלת החלטות ותהליכי תכנון ואסטרטגיה. קהלי היעד העיקריים מולם פועל המכון להגשמת ייעוד זה הם: מקבלי החלטות ומכתיבי מדיניות – ברמה המקומית והארצית; ארגוני חברה אזרחית; המגזר הפרטי והציבור הכללי הרחב, המתעניין בתכנון עירוני, מדיניות ציבורית וגיאוגרפיה אנושית. המכון מייצר תוצרים מעמיקים, מבוססי מידע וידע, שמאפשרים לקהלים אלו לגבש עמדותיהם ופעילותם באופן מושכל, מתוך הבנת הקשרים והשלכות רחבים