אגף האצת מצוינות פועל מתוך המדרשה הלאומית למנהיגות, ממשל וניהול, ומהווה כלי המסייע בחיבור ויצירת קהילה של עובדי השירות הציבורי בתחום המצוינות, על מנת לייצר אדוות של שינוי בכל שירות המדינה. האגף פועל ליצירת חדשנות ויזמות בקרב עובדי הנציבות, התאמת שירות המדינה לשוק העבודה המשתנה, פישוט תהליכי עבודה, הפחתת בירוקרטיה, הנגשת אפשרויות הוקרה (פריסת כלי ההוקרה וסדנאות לניהול חדשנות ממשלתית) והתנסות בכלים חדשים לשיתוף רעיונות ולהפצת הצלחות. האגף מקיים בכל שנה את תחרות החדשנות הממשלתית